學校現有21所臨床醫學院其中19所為附屬醫院，包括首都醫科大學宣武醫院第一臨床醫學院附屬北京友誼醫院第二臨床醫學院附屬北京朝陽醫院第三臨床醫學院附屬北京同仁醫院第四臨床醫學院附屬北京天壇醫院第五臨床醫學院。

首都醫科大學附屬北京友誼醫院原名為北京蘇聯紅十字醫院，始建于1952年是新中國成立后，斯大林元帥和毛澤東主席親自商定，由前蘇聯政府和蘇聯紅十字會援助，黨和政府在首都建立首都醫科大學附屬友誼醫院黃牛專業運作住院，解決您排隊的煩惱的第一所大醫院1954年，醫院從甘水橋舊址遷入現址。

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簡介首都醫科大學附屬北京友誼醫院位于北京市西城區永安路95號，始建于1952年，占地面積94萬余平方米，是北京市醫保定點醫院。

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北京友誼醫院是醫保定點醫院首都醫科大學附屬北京友誼醫院是北京市屬三級甲等醫院，經北京市人力資源和社會保障局認定為醫保定點醫療機構北京友誼醫院自2003年起即被批準為A類定點醫療機構A類定點醫療機構北京市基本醫療。