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2012年6月6日，值醫院掛牌五周年之際，14萬平方米的醫院綜合大樓正式啟用，配置床位1200張，更配備當前最高端的唯一能實現真正動態容積的640層CT，標志著醫院真正邁入國內先進醫療行列，這也成為醫院新的發展契機。

醫院醫療設施先進，擁有核磁共振螺旋CT多普勒彩超全自動生化分析儀等系列高級醫療設備急診暢通綠色通道，急診室24小時搶救病人現建有寧波市手外科研究所浙江中醫學院骨傷專業碩士研究生和上海復旦大學手外科研究生教育；2007年2月5日，廣州市政府將原廣州市第六人民醫院成建制整體移交中山大學，更名為中山大學附屬第六醫院胃腸肛門醫院，SYSUGIH中山六院是一所以胃腸肛門為?？铺厣木C合醫院，承擔醫療教學科研預防和康復等任務。

磁共振血球計數儀飛利浦C臂X線機飛利浦螺旋CT蔡司眼底激光儀卡爾史托斯腹腔鏡飛利普DR愛爾康超聲乳化儀等一系列高級醫療設備，并裝備集中供氧系統和中央空調，硬件和軟件建設已邁入了市二級醫院的先進行列；醫院的整體水平和醫療條件肯定是三院更好一些，不過六院原來就是廣東省胃腸肛門醫院，所以在胃腸肛門消化科方面是要比三院強的中山大學附屬第六醫院中山大學附屬第六醫院廣東省胃腸肛門醫院是一所綜合醫院中山大學附屬。

醫院各臨床科室設置齊全，設備先進其中普通外科為國家臨床重點?？?，結直腸肛門外科腎內科麻醉科醫學影像科等為廣東省臨床重點專科自掛牌以來，從海內外引進各學科學術帶頭人30多人，開設包括胃腸肛門專科內科外科。